Микробиологи обнаружили в прибрежном иле Китая ранее неизвестные гигантские вирусы с большим разнообразием, которые способны влиять на химический состав планеты.
Результаты исследования группы под руководством Цичао Ту из Института морских наук и технологий Шаньдунского университета опубликовал журнал Nature Communications. Ученые взяли около 200 образцов ила с приливных отмелей вдоль китайского побережья и обработали более 5 терабайт генетических данных, получив 237 крупных вирусных геномов. Самые крупные из них насчитывали сотни тысяч элементов ДНК.
Найденные геномы разделились на 2 группы. Около 66 процентов составили гигантские вирусы, поражающие водоросли и амеб. Остальная часть пришлась на гигантские фаги, охотящиеся на бактерии и несущие десятки генов для самовоспроизведения. Поражая организмы в основании пищевой цепи, такие вирусы оказывают влияние на целые сообщества.
Сортировка по родословным деревьям выявила 8 вирусов, образовавших отдельную группу в порядке Imitervirales, которую исследователи предварительно определили как новое семейство. При этом 7 из 8 этих вирусов оказались тесно связаны с членистоногими, что указывает на их возможную связь с животным миром.
Один гигантский фаг с полным геномом из почти 229 000 элементов был обнаружен во всех образцах из города Циндао. Каждая копия генома была идентична более чем на 99,9 процента, несмотря на разные сезоны и глубину забора материалов.
Наиболее сильную связь с вирусами показали грибы и одноклеточные организмы, питающиеся растительной пищей. Связь с грибами стала для исследователей неожиданностью, так как ранее они не считались хозяевами гигантских вирусов. Размещение вирусов в иле во многом определялось случайностью, которая ослабевала в местах скопления большого числа носителей.
Специалисты выявили сотни генов, связанных со строительными блоками ДНК, аминокислотами и сахарами. Гигантские вирусы оказались ориентированы на процессы круговорота углерода и переработки азота. Наличие этих генов предполагает роль вирусов в переработке элементов организмами-хозяевами, что может потребовать пересмотра подходов к изучению химии прибрежных зон в будущих исследованиях.